Окончил Омский танковый инженерный институт. Стал командиром танкового отделения и был направлен в город Чебаркуль Челябинской области.
Николай Агафонов отвечал за буксировку танков при прохождении болотистой местности в районе населённого пункта Бровары. Боевое задание по переправе было выполнено. Однако вскоре колонна подверглась артиллерийскому обстрелу в котором и 9 марта 2022г погиб старший сержант